Bayernweit zählt das Murnauer Moos zu einem der bedeutensten Wiesenbrütergebiete, welches teilweise noch gute Brutbestände vieler bedrohter oder bestandsgefährdeter Brutvogelarten beherbergt. Im Jahr 2021 wurden die Bestände von ausgewählten Wiesen- und Schilfbrütern auf ca. 3.400 ha im Murnauer Moos im Rahmen der landesweiten Wiesenbrüterkartierung sowie im Rahmen des Gebietsmonitorings erfasst. Herausfordernd waren hierbei vor allem die Größe sowie die Begehbarkeit des Gebietes.